本所於民國40年4月1日奉前陽明山管理局核准成立,為臺灣省三等事務所,編制員額9人。民國57年陽明山管理局改隸臺北市政府後,本所仍隸屬陽明山管理局。後因經濟迅速發展,人口不斷增加,土地登記業務亦隨之逐年增多,於民國62年9月編制人員調整為55人。民國63年元月因陽明山管理局裁併,改為臺北市士林地政事務所,隸屬於臺北市政府地政處。民國100年12月20日組織規程修正,原第一課、第二課、第三課及第四課之名稱,分別依業務功能及性質修正為「登記課」、「測量課」、「地籍資料課」及「行政課」,並配合臺北市政府地政處更名為臺北市政府地政局,本所隸屬改為臺北市政府地政局。民國103年11月30日組織規程修正,增設「資訊課」,係因應地政資料推展全面資訊化,綜整資訊規劃及資訊安全管理等事項。為利民國108年1月1日本市各地政事務所辧理跨縣市及目前跨所登記案件之作業方式一致,以及推動電腦線上作業跨所辦理地政業務,提升為民服務品質,增訂各地政事務所轄區及修訂職掌事項,爰於民國107年7月25日組織規程修正,並於108年1月1日施行。
茲因臺北市政府地政局考量臺北市各地政事務所係第一線為民服務機關,主要業務為辦理不動產登記及測量,各地政事務所雖劃分管轄區域,考量業務性質相同、屬性一致,各類推動業務人員之職稱、職等及職系亦相同,爰依考試院113年1月16日考授銓法五字第1125652071號函同意臺北市各地政事務所共用編制表規劃案,訂定「臺北市各地政事務所編制表」,併同廢止松山、古亭、建成、中山、大安及本所等6地政事務所編制表,並配合體例修正組織規程,自114年1月1日施行。本所現有編制員額97人,轄區為士林、北投。